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8.5B: 원핵생물의 분류 - 생물학

8.5B: 원핵생물의 분류 - 생물학


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원핵 생물은 지구상의 최초의 생명체였으며 아무리 극한 환경에서도 여전히 모든 환경에 서식합니다.

학습 목표

  • 지질학적 연대기의 관점에서 원핵생물의 기원에 대해 논의

키 포인트

  • 모든 생물은 도메인이라고 하는 세 가지 주요 그룹으로 분류할 수 있습니다. 여기에는 Archaea, Bacteria 및 Eukarya가 포함됩니다.
  • 원핵생물은 35억년에서 38억년 전 선캄브리아기 동안 발생했습니다.
  • 원핵 생물은 지구상의 모든 유형의 환경, 즉 매우 뜨거운 것부터 매우 추운 것, 초염도, 매우 산성에 이르기까지 살 수 있습니다.
  • 박테리아 및 고세균 도메인은 원핵 생물을 포함하는 도메인입니다.
  • Archaea는 화산 내부와 같은 극한 환경에 서식하는 원핵생물이며, Bacteria는 다음과 같은 보다 일반적인 유기체입니다. 대장균.

핵심 용어

  • 원핵생물: 세포가 핵이나 다른 막에 결합된 소기관이 없는 것을 특징으로 하는 유기체
  • 도메인: 세 영역 체계에서 유기체 분류에서 가장 높은 순위, 왕국 위: 박테리아, 고세균, 진핵
  • 고세균: 핵이 없는 단세포 유기체의 분류학적 영역으로 이전에는 고세균이라고 불렸지만 현재는 기본적으로 박테리아와 다른 것으로 알려져 있습니다.

원핵생물의 진화

최근에 과학자들은 다음과 같은 몇 가지 기준에 따라 생명체를 5개의 왕국(동물, 식물, 균류, 원핵생물, 원핵생물)으로 분류했습니다. 세포벽, 다세포성 등 20대 후반NS 세기에 Carl Woese와 다른 사람들의 선구적인 연구는 작은 소단위 리보솜 RNA(SSU rRNA)의 서열을 비교하여 지구상의 유기체를 그룹화하는 보다 근본적인 방법을 가져왔습니다. 세포막 구조와 rRNA의 차이에 근거하여 Woese와 그의 동료들은 지구상의 모든 생명체가 도메인이라고 하는 세 가지 계통을 따라 진화했다고 제안했습니다. 도메인 박테리아는 박테리아 왕국의 모든 유기체를 포함하고, 도메인 Archaea는 나머지 원핵생물을 포함하고, 도메인 Eukarya는 Animalia, Plantae, Fungi 및 Protista 왕국의 유기체를 포함한 모든 진핵생물을 포함합니다.

최초의 살아있는 유기체의 진화에 대한 현재 모델은 이것이 원핵생물의 일부 형태였으며, 이는 원생생물에서 진화했을 수 있다는 것입니다. 일반적으로 진핵생물은 생명의 역사에서 후기에 진화한 것으로 생각됩니다. 그러나 일부 저자들은 현재의 원핵 생물 종의 집합이 단순화 과정을 통해 더 복잡한 진핵 조상에서 진화했을 수 있다고 주장하면서 이 결론에 의문을 제기했습니다. 다른 사람들은 단일 유전자 풀을 형성하는 일련의 다양한 세포에서 생명의 세 영역이 동시에 발생했다고 주장했습니다.

세 영역 중 두 영역인 박테리아와 고세균은 원핵생물입니다. 화석 증거에 따르면, 원핵생물은 35억년에서 38억년 전 선캄브리아기 동안에 나타난 지구상의 최초의 거주자였습니다. 이 유기체는 풍부하고 어디에나 있습니다. 즉, 그들은 어디에나 존재합니다. 온건한 환경에 서식하는 것 외에도 극한 조건에서 발견됩니다. 끓는 샘에서 남극 대륙의 영구적으로 얼어 붙은 환경에 이르기까지; 사해와 같은 염분 환경에서 바다의 깊이와 같은 엄청난 압력을 받는 환경에 이르기까지; 폐기물 관리 공장과 같이 산소가 없는 지역에서 체르노빌과 같은 방사능 오염 지역까지. 원핵생물은 인간의 소화기관과 피부에 상주하며 특정 질병의 원인이 되며 많은 음식을 준비하는 데 중요한 역할을 합니다.


원핵생물의 수평 유전자 전달: 정량화 및 분류

추상적 인박테리아, 고세균 및 진핵 생물 게놈의 비교 분석은 원핵 생물 게놈에서 유전자의 상당 부분이 수평 이동의 대상임을 나타냅니다. 어떤 경우에는 수평적 유전자 전달의 양과 출처가 유기체의 생활 방식과 연결될 수 있습니다. 예를 들어, 세균성 고호열체는 다른 세균보다 훨씬 더 많은 고세균과 유전자를 교환한 것으로 보이지만, 특정 부류의 진핵생물 유전자의 전달은 기생 및 공생 세균에서 가장 일반적입니다. 수평 전달 이벤트는 새로운 유전자의 획득, 기존 유전자의 파라로그 획득, 및 유전자가 다른 계통(xenolog)에서 수평으로 전달된 오르토로그에 의해 대체되는 이종 유전자 변이의 뚜렷한 범주로 분류될 수 있습니다. 이러한 유형의 수평 유전자 전달은 각각 원핵생물에서 일반적이지만, 이들의 상대적 기여도는 혈통에 따라 다릅니다. 수평으로 전달된 유전자의 고정 및 장기간 지속성은 수용 유기체에 선택적인 이점을 부여함을 시사합니다. 대부분의 경우 이러한 이점의 특성은 명확하지 않지만 박테리아가 진핵생물 유전자를 획득한 여러 사례를 자세히 조사하면 관련된 진화력이 밝혀지는 것 같습니다. 예에는 여러 박테리아에 의한 진핵생물로부터의 획득이 항생제 내성과 연결된 이소류실-tRNA 합성효소, 세포내 기생 박테리아에 의해 획득된 ATP/ADP 트랜스로카제, 분명히 식물로부터의 클라미디아 및 리케차, 및 클라미디아 병인과 관련될 수 있는 프로테아제가 포함됩니다.


Archaea: 계통학

Archaea는 알려진 모든 생명체가 분할될 수 있는 세 영역 중 하나를 구성합니다. 삶에는 두 가지 다른 영역이 있습니다. 이들 중 하나는 식물, 동물, 균류 및 원생생물을 포함하는 진핵생물입니다. 원생생물을 제외하고 이 유기체는 아리스토텔레스 시대부터 알려지고 연구되어 왔으며 가장 친숙한 유기체입니다. 발견된 두 번째 영역은 17세기 네덜란드 박물학자 Antony van Leeuwenhoek와 같은 사람들이 현미경으로 처음 관찰한 박테리아였습니다.

박테리아의 작은 크기로 인해 연구하기가 어려웠습니다. 초기 분류는 개인의 모양, 실험실 문화에서 식민지의 모양 및 기타 물리적 특성에 따라 다릅니다. 생화학이 현대 과학으로 꽃을 피우면서 화학적 특성을 이용하여 세균을 분류하기도 했지만 이 정보만으로는 작은 미생물을 확실하게 식별하고 분류할 수 없었습니다. 신뢰할 수 있고 반복 가능한 박테리아 분류는 분자 생물학이 DNA 염기서열의 배열을 가능하게 한 20세기 후반까지 불가능했습니다.

DNA 분자는 모든 생물의 세포에서 발견되며 세포가 단백질 및 기타 세포 구성 요소를 만드는 데 필요한 정보를 저장합니다. 세포의 가장 중요한 구성 요소 중 하나는 리보솜, DNA 메시지를 화학 제품으로 변환하는 크고 복잡한 분자. 리보솜의 대부분의 화학 성분은 RNA, DNA와 매우 유사한 분자로 고유한 구성 요소 시퀀스를 가지고 있습니다. 분자생물학자는 시퀀싱 기술을 사용하여 RNA의 구성 요소를 하나씩 분해하고 각각을 식별할 수 있습니다. 결과는 순서 그 빌딩 블록의.

리보솜은 생물의 기능에 매우 중요하기 때문에 급속한 진화를 일으키지 않습니다. 리보솜 서열의 주요 변화는 리보솜이 세포를 위한 새로운 단백질을 구축하는 임무를 수행할 수 없게 만들 수 있습니다. 이 때문에 우리는 리보솜의 서열이 다음과 같다고 말합니다. 보존 -- 시간이 지나도 크게 변하지 않는다는 것. 이 느린 분자 진화 속도는 리보솜 서열을 박테리아 진화의 비밀을 풀기 위한 좋은 선택으로 만들었습니다. 다양한 박테리아 사이에서 리보솜 서열의 약간의 차이를 비교함으로써 유사한 서열의 그룹을 발견하고 관련 그룹으로 인식할 수 있습니다.

1970년대에 일리노이 대학(University of Illinois at Urbana-Champaign)의 Carl Woese와 그의 동료들은 박테리아 관계에 대한 더 나은 그림을 개발할 목적으로 박테리아의 서열을 조사하기 시작했습니다. 그들의 발견은 1977년에 출판되었으며, 여기에는 큰 놀라움이 포함되었습니다. 모든 작은 미생물이 밀접하게 관련된 것은 아닙니다. 분석에서 박테리아와 진핵생물 그룹 외에도 메탄 생성 미생물의 세 번째 그룹이 있었습니다. 이것들 메탄 생성 물질 그들은 산소에 의해 죽임을 당하고 특이한 효소를 생산하고 알려진 모든 박테리아와 다른 세포벽을 가지고 있기 때문에 미생물 세계에서 화학적으로 이상한 것으로 이미 알려져 있습니다.

Woese의 연구의 중요성은 그가 이러한 기이한 미생물이 생물학의 가장 기본적인 수준에서 다르다는 것을 보여주었다는 것입니다. 그들의 RNA 염기서열은 물고기나 꽃처럼 박테리아의 염기서열과 비슷하지 않았습니다. 이 엄청난 차이를 인식하기 위해 그는 그룹을 "Eubacteria"(진정한 박테리아)와 구별하기 위해 "Archaebacteria"라는 이름을 붙였습니다. 이 유기체들 사이의 진정한 분리 수준이 명확해짐에 따라 Woese는 원래 이름을 다음과 같이 줄였습니다. 고세균 고세인들이 단순히 박테리아 그룹이라고 생각하지 않도록 하기 위해.

라는 발견 이후 메탄 생성 물질 박테리아가 아닌 Archaea에 속하며 다른 많은 고고 그룹이 발견되었습니다. 여기에는 극도로 짠 물에서 번성하는 정말 이상한 미생물과 끓는점에 가까운 온도에서 사는 미생물이 포함됩니다. 훨씬 더 최근에 과학자들은 해양 표면, 깊은 바다 진흙, 염습지, 동물의 내장, 심지어 지구 표면 깊숙한 석유 매장지와 같은 서식지의 증가하는 배열에서 고세균을 찾기 시작했습니다. Archaea는 불과 25년 만에 무명에서 거의 유비쿼터스 상태가 되었습니다!

Archaeans는 점점 더 과학적 조사의 연구 대상이되었습니다. 많은 면에서 고세균 세포는 박테리아의 세포와 유사하지만 여러 가지 중요한 측면에서 진핵생물의 세포와 더 비슷합니다. Archaea가 박테리아의 가까운 친척인지 또는 우리 그룹인 진핵 생물인지에 대한 질문이 발생합니다. 이것은 대답하기 매우 어려운 질문입니다. 왜냐하면 우리는 오늘날 우리 주변에 비교할 생명의 초기 조상이 없는 생명나무 자체의 가장 깊은 가지에 대해 이야기하고 있기 때문입니다. 문제를 해결하는 데 사용되는 한 가지 새로운 접근 방식은 복제 유전자. 일부 DNA 서열은 각 세포 내에서 두 개 이상의 사본으로 발생하는데, 아마도 과거 어느 시점에서 여분의 사본이 만들어졌기 때문일 것입니다. 모든 살아있는 세포에 복제 사본으로 존재하는 것으로 알려진 유전자는 거의 없으며, 이는 복제가 생명의 세 영역이 분리되기 전에 발생했음을 시사합니다. 두 세트의 염기서열을 비교하면서 과학자들은 고세균이 실제로 박테리아보다 우리(및 다른 진핵생물)와 더 밀접하게 관련되어 있을 수 있음을 발견했습니다.


원핵 및 진핵 조류에 대한 간략한 참고 사항

조류의 세포 조직에는 두 가지 주요 패턴이 있습니다. 그들은 원핵 생물과 진핵 생물입니다.

1. 원핵 조류:

청록색 조류(Cyanophyceae 또는 Cyanophycophyta)는 원핵 조류입니다. 이 조류에서 핵 물질인 디옥시리보-핵산(DNA)은 핵막에 의해 원형질의 나머지 부분과 구분되지 않고 오히려 세포 전체에 어느 정도 분산됩니다. 막 경계 색소체는 세포질에서 자유롭게 발생하는 광합성 라멜라가 없습니다.

이미지 제공: Planetforward.org/sites/default/files/pond-algae4.jpg

소포체, 미토콘드리아 및 골지 장치도 없습니다. 많은 녹조류(Chlorophyceae 또는 Chlorophycophyta)에서 발생하는 것과 같은 큰 수액 액포는 청록색 조류의 세포에는 없습니다. 또한, 남조류의 세포벽은 박테리아의 세포벽과 화학적 유사성을 보입니다. 특정 남조류는 박테리오파지와 유사한 바이러스에 감염될 수 있으며, 이는 남조류와 박테리아 사이의 유사성을 더 많이 주장하므로 이를 남조류라고 합니다.

2. 진핵 조류:

반면에, 진핵 조류의 세포는 미세하게 천공된 핵막 내에 DNA가 국한되어 있으며 핵은 본질적으로 고등 식물의 핵과 유사합니다. 이러한 광합성 라멜라는 잘 정의된 엽록체뿐만 아니라 막 내에 제한되어 있습니다. 엽록체는 각 세포 내에서 단독으로 발생하는 거대하거나 정수리 또는 별 모양의 구조일 수 있으며, 비조류 녹색 식물에서와 같이 리본 모양, 막대 모양, 그물 모양 또는 원반 모양 구조의 형태일 수 있습니다.

많은 녹조류(Chlorophyceae), 황금조류(Chrysophyceae), 갈조류(Phaeophyceae) 및 홍조류(Rhodophyceae)에서 특수 영역인 피레노이드가 색소체 내에 존재합니다. 녹조류에서 피레노이드는 일반적으로 전분 알갱이로 둘러싸여 있습니다. 피레노이드는 포도당의 전분으로의 효소적 축합의 중심이라고 생각됩니다.

소포체, 미토콘드리아 및 골지체는 지금까지 연구된 모든 진핵 조류의 세포에 존재합니다.

조류의 운동성 세포는 편모형일 수 있습니다. 운동성과 관련된 것은 수축성 공포, 편모 및 낙인과 같은 구조입니다.


NEET 생물학 챕터 와이즈 모의 테스트 및 #8211 생물학적 분류

1. 모든 모네란
(a) DNA와 RNA를 포함
(b) 핵막으로 둘러싸여 있지 않은 긴 원형 DNA 가닥을 보여줍니다 0
(c) 박테리아이다
(d) 위의 모든 것

2. 가장 원시적인 모네란은
(a) 리케차에
(b) 방선균
(c) 프로제노트
(d) 고세균

3. 염전과 염습지에서 발견되는 고세균은
(a) 메탄 생성 물질
(b) 열산성 물질
(c) 반추공생동물
(d) 호염성 물질

4. Thermococcus, Methanococcus 및 Methanobacterium의 예
(a) 진핵생물 코어 히스톤과 상동성 단백질을 함유하는 고세균
(b) 진핵생물에서 발견되는 것과 유사한 히스톤이 없지만 DNA가 음으로 슈퍼코일된 고세균
(c) DNA가 rolaxed 또는 positive supercoiled이지만 세포골격과 미토콘드리아가 있는 박테리아
(d) 세포골격과 리보솜을 포함하는 박테리아

5. 대장균의 여분의 핵 DNA는
(a) F+ 계수
(b) 성 요인
(c) 에피솜
(d) 이들 모두

6. 박테리아는 다음과 같은 존재 때문에 동물보다 식물로 간주되었습니다.
(a) 작은 핵
(b) 원형질막
(c) 세포벽
(d) 포자 형성

7. 보툴리누스 중독을 일으키는 세균(Clostridium botulinum)은
(a) 통성 혐기성 미생물
(b) 절대 혐기성 미생물
(c) 통성 호기성 미생물
(d) 절대 호기성 미생물

8. 용해 단계의 박테리오파지가 박테리아의 부분적으로 소화된 염색체의 일부를 다른 숙주 세포로 운반할 때 이 과정을
(a) 변형
(b) 일반 형질도입
(c) 제한된 형질도입
(d) 활용

9.세균 형질도입에 대한 설명으로 옳은 것은?
(a) 바이러스를 통해 한 박테리아에서 다른 박테리아로 일부 유전자 전달
(b) 접합에 의해 한 박테리아에서 다른 박테리아로 유전자 전달
(c) 박테리아가 DNA를 직접 획득
(d) 박테리아가 다른 외부 소스에서 DNA를 얻은 경우

10. 접합에서 역할을 하는 생식력 또는 F+ 인자는
(a) 레트로바이러스
(b) 플라스미드
(c) 바이로이드
(d) 용원성 파지

11. 찻잎의 경화는
(a) 박테리아
(b) 균근
(c) 바이러스
(d) 곰팡이

12. 질산화 박테리아가
(a) 질산염에서 아질산염으로
(b) 아질산염에서 질산염으로
(c) 암모늄염을 질산염으로
(d) 암모늄염을 아미노산으로

13. 섬모에 관한 다음 설명 중 옳지 않은 것은?
(a) 섬모의 조직화된 박동은 막을 가로지르는 Ca2+의 흐름에 의해 제어됩니다.
(b) 섬모는 머리카락과 같은 세포 부속기입니다.
(c) 섬모의 미세소관은 튜불린으로 구성
(d) 섬모는 2개의 단일 미세소관을 둘러싸고 있는 9개의 이중선 미세소관의 외부 고리를 포함합니다.

14. 박테리아 게놈은
(a) 핵
(b) 핵소체
(c) 핵체
(d) 이들 중 어느 것도

15. 세균 편모는 ATPase 활성 및9 + 2 조직을 나타내지 않습니다. 이들은 화학적으로
(a) 플라겔린
(b) 필린
(c) 튜불린
(d) 박테린

16. 산소가 부족한 토양에 서식하는 특정 박테리아는 질산염을 아질산염 qpd로 변환한 다음 유리 질소로 전환하며 이러한 박테리아는 다음과 같습니다.
(a) 질소 고정 박테리아
(b) 탈질균
(c) 암모니아화 박테리아
(d) 부생균

17. 호염기성 원핵생물
(a) 높은 고도의 고알칼리성 얼어붙은 호수에서 천천히 자랍니다.
(b) 고농도의 수산화바륨을 함유한 물에서 발생
(c) 매우 깊은 해양 퇴적물에서 성장 및 번식
(d) 용해성 바륨 염이 풍부한 해수에서 쉽게 성장 및 분열

18. 방선균 사상 토양 박테리아 Frankia에 관한 다음 설명은 모두 Frankia가 맞다는 점을 제외하고는 정확합니다.
(a) 많은 식물 종에 뿌리 결절을 유발할 수 있습니다.
(b) 자유 생활 상태에서 질소를 고정할 수 있습니다.
(c) Rhizobium과 마찬가지로 일반적으로 뿌리털 변형을 통해 숙주 식물을 감염시키고 숙주의 피질에서 세포 증식을 자극합니다.
(d) 질소화효소가 트리테르펜 호파노이드를 포함하는 화학적 장벽에 의해 산소로부터 보호되는 특수 소포를 형성합니다.

19. 다음 중 위염과 소화성 궤양 질환에 중요한 역할을 하는 박테리아는 무엇입니까?
(a) 결핵균.
(b) 헬리코박터 파일로리
(c) 써모필러스 아쿠아티쿠스
(d) 메틸로필루스 메틸로트로프’us

20. 세균성 편모는 다음으로 구성됩니다.
(a) 단백질
(b) 아민
(c) 지질
(d) 탄수화물

21. 박테리아 Pseudomonas는 다음과 같은 능력 때문에 유용합니다.
(a) 한 식물에서 다른 식물로 유전자를 전달
(b) 다양한 유기 화합물을 분해
(c) 토양에 대기 질소를 고정
(d) 다양한 항생제 생산

22. 박테리아 게놈과 통합되고 통합된 바이러스 게놈은
(a) 예언
(b) RNA
(c) DNA
(b) (a)와 (c) 모두

23. 세계 해양에서 가장 큰 독립영양생물의 바이오매스는
(a) 저서 갈조류, 연안 홍조류 및 물벼룩류
(b) 저서 규조류 및 해양 바이러스
(c) 해초 및 점액 곰팡이
(d) 부유하는 미세조류, 남조류 및 나노플랑크톤

24. 남조류와 박테리아의 세포는 다음과 같은 점에서 유사성을 나타냅니다.
(a) 색소체
(b) 핵
(c) 중심체
(d) 네이키드 DNA

25. 양치류 Azolla와 공생 관계를 형성할 수도 있는 자유 생활 질소 고정 시아노박테리움은 다음과 같습니다.
(a) 톨리포트릭스
(b) 클로렐라
(c) 노스톡
(d) 아나바에나

26. 마이코플라즈마(PPLO)에서 plasmalemma는 다음이 풍부합니다.
(a) 콜레스테롤
(b) 글리코겐
(c) 셀룰로오스
(d) 미오신

27. 마이코플라즈마는 바이러스에 민감하다는 점에서 바이러스와 다릅니다.
(a) 페니실린
(b) 테트라사이클린
(c) 설탕
(d) 아미노산

28. 마이코플라스마의 외부 제한층은 층이다.
(a) 슬라임 층
(b) 점액층
(c) 세포벽
(d) 세포막

29. 마이코플라스마에 대한 다음 설명 중 옳지 않은 것은?
(a) PPLO라고도 합니다.
(b) 그것들은 다형성이다
(c) 페니실린에 민감하다
(d) 식물에 질병을 일으킨다.

30. 다음 미생물 중 세포벽이 없는 가장 작은 살아있는 세포는?
(a) 바이러스
(b) 고세균
(c) 마이코플라스마
(d) 진균

31. 광우병의 원인균은
(a) 박테리아
(b) 프리온
(c) 벌레
(d) 바이러스

32. 바이러스에 대한 설명으로 옳지 않은 것은?
(a) 바이러스에는 단백질 외에도 DNA 또는 RNA가 될 수 있는 유전 물질이 포함되어 있습니다.
(b) 어떤 바이러스도 RNA와 DNA를 모두 포함하지 않습니다.
(c) 바이러스는 핵단백질이고 유전물질은 전염성이 있다
(d) 캡시드(capsid)라고 하는 단백질 외피는 바이로이드(viroids)라고 하는 작은 소단위체로 구성됩니다.

33. 박테리아를 감염시키는 바이러스는 증식하여 용해를 유발합니다.
(a) 리소자임
(b) 지방분해
(c) 용해
(d) 용원성

34. 1971년 TO Diener는 바이러스보다 작고 바이로이드로 알려진 새로운 감염원을 발견했습니다. 다음 중 바이로이드에 의해 발생하는 질병은?
(a) 바나나의 뭉툭한 꼭대기
(b) 마녀 빗자루
(c) 감자방추결절병
(d) 상기 사항 없음

35. 세포 이론은 Schleiden과 Schwann에 의해 제안되었습니다.
다음 중 세포이론의 예외로 옳지 않은 것은?
(a) 고세균
(b) 진균
(c) 바이러스
(d) 과편모조류

36. 올바른 진술은
(a) 일반적으로 식물을 감염시키는 바이러스는 단일 가닥 RNA를 가지고 있습니다.
(b) 일반적으로 동물을 감염시키는 바이러스는 단일 또는 이중 가닥 RNA 또는 이중 가닥 DNA를 가지고 있습니다.
(c) 박테리오파지는 이중 가닥 DNA 바이러스입니다.
(d) 위의 모든 것

37. 단일 가닥 DNA는 다음에서 발견됩니다.
(a) TMV (b) 마이코박테리움
(c) ∅ x 174 (d) 모든 바이러스

38. 이중 가닥 RNA는 다음에서 발견됩니다.
(a) 레오바이러스
(b) TMV
(c) T2-박테리오파지
(d) T4-박테리오파지

39. Contagium vivum fluidum은 다음과 같이 제안되었습니다.
(a) DJ 이바노프스키
(b) MW 베이제링크
(c) 스탠리
(d) 로버트 후크

40. 시아노파지에서 유전 물질은
(a) DNA (b) RNA
(c) (a)와 (b) 모두
(d) 단백질

41. 바이러스성 질병과 같은 증상을 일으키는 알몸 RNA 입자는 다음과 같이 알려져 있습니다.
(a) 바이로이드
(b) 비리온
(c) 바이러스
(d) 이들 중 어느 것도

42. 단백질로 구성된 바이러스의 외부 덮개는
(a) 캡시드
(b) 코트
(c) 비리온
(d) 바이로이드

43. Rickettsiae는 다음 그룹에 속합니다.
(a) 바이러스 박테리아 사이의 독립적인 범주
(b) 곰팡이
(c) 바이러스
(d) 박테리아

44. 다음 중 점액 곰팡이는 무엇입니까?
(a) 리조푸스
(b) Physarum
(c) 티오바실러스
(d) 아나바에나

45. 점균류(Myxomycetes)의 엽체는 다음과 같이 알려져 있습니다.
(a) 양성자종
(b) 변형체
(c) 자실체
(d) 균사체’

46. ​​Trypanosoma, Noctiluca, Monocystis 및 Giardia의 공통점은 무엇입니까?
(a) 이들은 모두 단세포 원생생물이다
(b) 편모가 있다
(c) 그들은 포자를 생성한다
(d) 이들은 모두 기생충이다

47. 보조포자와 호모포자는 각각 다음과 같이 구성됩니다.
(a) 여러 규조류와 소수의 남세균
(b) 여러 남세균과 여러 규조류
(c) 일부 규조류와 여러 남세균
(d) 일부 남조류와 많은 규조류

48. 점액곰팡이-Myxomycota(진정한 점액곰팡이)는
(a) pseudoplasmodia
(b) 자유 생활 아메보이드 세포로 발달하는 포자
(c) 편모 배우자로 발달하는 포자
(d) 고독한 개별 세포로 구성된 공급 단계

49. 다음 중 적조를 일으키는 과편모조류는?
(a) 아나바에나
(b) 고냐로
(c) 마이코플라스마
(d) 고세균

50. 점균류와 다세포 조류는 현재 왕국-원생생물에 포함되어 있다.
(a) 단세포 진핵생물과 더 밀접한 관련이 있는 것으로 보인다
(b) 균류와 식물의 중요한 특성이 부족하고,
(c) 왕국-원생생물은 분명히 다른 세 왕국에 속하지 않는 진핵생물을 포함한다.
(d) 위의 AII

51. 다음 중 옳지 않은 것은?
(a) 아메바류 원생동물 — 아메바
(b) 편모가 있는 원생동물 - 트리파노소마
(c) 포자동물 - Anopheles
(d) 섬모 원생동물 — Paramecium

52. 다음 단세포 유기체 중 영양 기능을 위한 대핵과 생식을 위한 하나 이상의 소핵을 가진 것은 무엇입니까?
(a) 유글레나
(b) 아메바
(c) 기생충
(d) 트리파노소마

53. 인간, Plasmodium의 수명주기에서
(a) 기본 호스트
(b) 보조 호스트
(c) (a)와 (b) 모두
(d) 이들 중 어느 것도

54. 다음 중 원생동물의 운동기관이 아닌 것은?
(a) 섬모
(b) 편모
(c) Parapodia
(d) 위족류

55. 황금 갈색 원생 생물은
(a) Chrysophytes
(b) 유글레노이드
(c) 과편모조류
(d) 규조류

56. 그들의 theca에 가로 및 세로 홈이 있는 원생생물은
(a) 유공충
(b) 방산사
(c) 규조류
(d) 과편모조류

57. 핵 이형성은 그룹에서 발생합니다.
(a) 동물편모
(b) 섬모
(c) 포자충
(d) 사르코디나

58. 점액균류는
(a) 균사체를 갖는 사프로브 또는 기생충, 단편화에 의한 무성 생식, 배우자 융합에 의한 유성 생식
(b) 음식물을 삼키기 위한 위족과 같은 구조를 갖는 다핵 원형질의 끈적끈적한 덩어리, 분열 또는 유주자를 통한 번식
(c) 이분법으로 번식하는 원핵생물, 세포 또는 무세포, 동식물 또는 독립영양생물
(d) 진핵생물, 단세포 또는 사상체 saprobe 또는 독립영양생물, 반수체 개체의 분열에 의한 무성생식, 두 세포 또는 그 핵의 융합에 의한 유성생식

59. 다음 표에서 작물과 그 병원체의 정확한 짝짓기를 식별하십시오. 질병과 그에 상응하는
작물 질병 병원체
(a) 감귤류 구충제 Pseudomonas rubrilineans
(b) 감자 역병 Fusarium udum
(c) Brinjal Root-knot Meloidogyne incognita
(d) 비둘기 완두콩 종자 담즙 Phytophthora infestans

60. 곰팡이 성주기와 관련하여 올바른 순서를 선택하십시오.
(a) Karyogamy, plasmogamy 및 감수 분열
(b) 감수분열, plasmogamy 및 karyogamy
(c) Plasmogamy, karyogamy 및 감수분열
(d) 감수분열, 핵분열 및 변형체

61. 이핵이 형성되면
(a) 감수 분열이 체포되다
(b) 두 개의 반수체 세포는 즉시 융합되지 않는다
(c) 세포질이 융합되지 않는다
(d) 상기 사항 없음

62. 대부분의 균류에서 식품 재료는 다음과 같은 형태로 저장됩니다.
(a) 전분
(b) 포도당
(c) 자당
(d) 글리코겐

방향 (Q. Nos. 63-65) 다음 각 질문에서 Assertion의 진술이 제공되고 Reason의 해당 진술이 뒤따릅니다. 진술 중 다음과 같이 정답을 맞춥니다.
(a) Assertion과 Reason이 모두 참이고 Reason이 Assertion에 대한 올바른 설명입니다.
(b) Assertion과 Reason은 모두 참이지만 Reason은 Assertion에 대한 올바른 설명이 아닙니다.
(c) 주장은 참이지만 이성은 거짓이다.
(d) 주장은 거짓이지만 이유는 참이다

63. 주장 모네라는 모든 원핵생물을 포함합니다.
이유 모네란의 핵은 핵막, 핵질 염색 섬유 및 핵소체로 구성되지 않습니다.

64. 주장 박테리아에서 염색체는 조밀한 덩어리로 불규칙하게 접혀 있으며, 핵형 또는 명확한 형태의 유전단(genophore)입니다.
이유 세균에는 조직화된 핵이 없다

65. 주장 진핵 세포는 원핵 세포보다 더 많은 DNA를 가지고 있습니다.
이유 진핵생물은 유전적으로 원핵생물보다 더 복잡합니다.

66. 다음 중 한 조각의 빵에서 Mucor의 최적 성장에 필수적인 환경 조건은 무엇입니까?
I. 약 25°C의 온도.
Ⅱ. 약 5°C의 온도.
III. 상대 습도 약 5%.
IV. 약 95%의 상대 습도.
V. 그늘진 곳.
VI. 밝은 조명이 있는 곳.
다음 옵션에서 답을 선택하세요.
(a) I, IV 및 V (b) II, IV 및 V
(c) II, III 및 VI (d) I, III 및 V

67. phycomycetes의 구성원은 다음에서 발견됩니다.
I. 수중 서식지
Ⅱ. 썩어가는 나무에 ‘
III. 습하고 습한 곳
IV. 식물의 절대 기생충으로
다음 옵션에서 선택합니다.
(a) 나 및 IV
(b) II 및 III
(c) I, II, III 및 IV.
(d) 상기 사항 없음

68. 다음 중 맞는 것은?
컬럼 1 컬럼 II 컬럼 III
(a) Phytophthora Aseptate 균사체 담자균류
(b) Alternaria Deuteromycetes가 없는 유성 생식
(c) 자낭균 접합에 의한 점액 생식
(d) 아가리쿠스 기생균 담자균류

69. 다음 중 이성애를 나타내는 것은 무엇입니까?
(a) 리조푸스
(b) 박테리아
(c) 사이카스
(d) 리시누스

70. 다음 중 시아노파지란 무엇입니까?
(a) S-13 (b) ∅x174 (c) SV – 40 (d) LPP-1

71. 레그헤모글로빈은
(a) 질소 고정
(b) 02로부터 질소분해효소 보호
(c) 박테리아를 파괴
(d) 식물에서 식품의 수송

72. ‘고세균은 다음과 같은 점에서 진균과 다릅니다.
(a) 세포막 구조
(b) 영양 방식
(c) 세포 모양
(d) 재생산 방식

73. 다음 중 깊은 곳에 존재할 가능성이 있는 것은?
해수?
(a) 진균
(b) 청녹조류
(c) 부영양화
(d) 고세균

74. 일부에 막 확장을 포함하는 안료
남세균은
(a) 기초체
(b) 기압기
(c) 크로마토포어
(d) 이종포자

75. 구연산의 좋은 생산자는
(a) 슈도모나스
(b) 클로스트리디움
(c) 사카로마이세스
(d) 아스페르길루스

76. Protists는 음식을 다음과 같이 얻습니다.
(a) 광합성제
(b) 화학합성기
(c) 종속영양생물
(d) (a)와 (c) 모두

77. 광합성 박테리아는
(a) 안료 시스템 I
(b) 안료 시스템 II
(c) (a)와 (b) 모두
(d) 다른 종류의 안료, B890

78. 단세포 진핵생물은
(a) 원생생물
(b) 곰팡이
(c) 고세균
(d) 모네라
답변 :


논의

SNARE 단백질의 보존된 메커니즘과 구조는 오랫동안 인식되어 왔지만(Reviewed in Hong, 2005 Jahn and Scheller, 2006), 지금까지는 포괄적인 분류가 부족했습니다. 계층적 클러스터링과 함께 psi-BLAST를 사용하여 SNARE를 분류하려는 첫 번째 시도는 분명히 열등한 정확도를 보였습니다. 클러스터 접근 방식을 사용하는 SNARE 제품군에 대한 최근 발표된 설문조사는 이러한 인상을 돕습니다(Yoshizawa et al., 2006), 여러 잘 알려진 SNARE가 발견되지 않았고 서열이 상동체가 아닐 수 있는 함께 클러스터링되었기 때문입니다.

우리는 HMM 프로파일과 계통 발생 분석을 사용하여 SNARE를 체계적으로 식별하고 분류했습니다. sequence orthology는 기능의 신뢰할 수 있는 예측자이기 때문에 우리의 분류 체계는 촉매화된 수송 단계에 대한 귀중한 통찰력을 제공합니다. 또한, 우리의 분류는 de novo found SNARE 시퀀스에 고유한 클래스를 할당하는 매우 중요한 방법으로 사용될 수 있습니다. 세포 생물학을 위한 매우 유용한 도구로서 우리는 결과에 액세스하고 분류에 따라 새로운 시퀀스를 쿼리하기 위해 웹 기반 인터페이스를 구현했습니다.

우리의 분류에 더 잘 맞는 내막 시스템을 더 많이 사용하는 원생생물의 SNARE

우리 연구에서 대부분의 SNARE 서열은 동물, 식물 및 곰팡이의 게놈에서 유래하므로 현재 분류 ​​체계는 특히 이러한 왕국의 SNARE를 분류하는 데 적합합니다. 여러 동종 SNARE의 경우, 이 나무는 이 왕국 내에서 종의 계통 발생적 관계를 매우 정확하게 반영합니다. 그러나 대부분 엔도솜 및 분비 경로인 인신매매 경로와 세포 소기관의 형태학적 및 기능적 적응도 SNARE 나무의 패턴에 영향을 미쳤습니다. 가장 깊은 진핵생물 분열은 식물과 대부분의 원생생물을 한 쪽에 배치하고 균류, 동물, 일부 아메바를 다른 면에 배치한다고 제안되었습니다(Philippe et al., 2000 Stechmann 및 Cavalier-Smith, 2002 Richards 및 Cavalier-Smith, 2005). 정확하다면, 동물, 균류, 식물의 SNARE 세트를 비교하면 모든 진핵 생물의 분비 장치의 바우플란을 대략적으로 설명하기에 충분할 것입니다. 그럼에도 불구하고 11종을 모두 포함하는 계통수(보충 재료)에서 일부 원생생물의 SNARE는 종종 분리됩니다. 다른 원생생물의 더 많은 염기서열이 우리 분류에 포함될 것이기 때문에 이것이 바뀔 것이라고 믿습니다. 이 현상은 이미 여러 종이 포함된 apicomplexa에서 볼 수 있습니다.Plasmodium, 테일레리아, 그리고 크립토스포리디움). 유사하게, kinetoplastid 기생충의 SNARE는 트리파노소마 브루세이, 티크루지, 그리고 리슈마니아 전공 그들의 친밀한 관계를 반영하기 위해 일반적으로 또한 모였습니다. 전체 게놈을 사용할 수 있는 대부분의 원생생물에서 우리는 지금까지 확립된 레퍼토리를 보완하는 합리적인 SNARE 단백질 모음을 발견했습니다(Dacks and Doolittle, 2002, 2004 Besteiro et al., 2006 쉴드 et al., 2006년 요시자와 et al., 2006년 아용 et al., 2007 키스멜 et al., 2007). 예를 들어, 열대열원충 거의 모든 다른 하위 그룹이 표시된 22개의 SNARE를 찾았습니다. 을위한 엘 메이저 우리는 28개의 SNARE 시퀀스를 발견했지만 지금까지 ER-수송(그룹 I)과 관련된 보다 편차가 큰 Q-SNARE 중 한 가지 유형(Sec20, Qb.I)만 찾았습니다. 그러나 결론을 내리기 전에 여러 원생생물 게놈이 완전히 시퀀싱되었지만 사용 가능한 데이터는 여전히 약간 단편적이라는 점을 염두에 두어야 합니다.

현대의 많은 혐기성 진핵생물은 최근까지 원시적으로 미토콘드리아가 부족하고 보다 원시적인 내막 시스템을 가지고 있는 것으로 생각되었습니다. 예를 들어, 기생 원생생물 지아르디아 was thought to lack a morphologically identifiable Golgi apparatus. Formerly, Giardia was thought to have diverged before the acquisition of such organelles. 하지만, Giardia was found not only to contain rudimentary mitochondria (Embley and Martin, 2006), it also possess several key factors of membrane trafficking, among them SNARE proteins (Dacks and Doolittle, 2002, 2004 Marti et al., 2003a,b). In fact, with only 15 detected SNAREs, Giardia has a clearly smaller set as compared with most other unicellular eukaryotic organisms. Principally, the SNAREs of Giardia are compatible with our classification however, SNAREs belonging to group II, which is involved in Golgi transport, appear to lack. 때문에 Giardia does not possess a conventional Golgi apparatus (Marti et al., 2003a,b), a possible explanation is that an entire SNARE unit, and hence the vesicular trafficking route mediated by these SNAREs, has been lost in this organism. Another possibility, however, is that the group II SNARE proteins in Giardia are too derived to be detected by our HMM profiles.

In contrast to the compact set in Giardia, we found 31 SNAREs in the genome of Entamoeba histolytica. Remarkably, in this organism the Q-SNAREs involved in ER transport (group I) appear to lack. As the sequences of this SNARE group are often more derived, we again cannot rule out that our current HMM profiles do not detect these sequences in this organism. Because we found at least one member of the group I SNAREs in all major groups of eukaryotes that are represented by the current data set, it is likely that this vesicular trafficking step was also present in the common ancestor.

Thus, although the SNAREs of several different protozoan parasites often form long branches in our trees, our analysis does not support the notion that their endomembrane system is more primitive but rather might be a degenerate feature of their parasitic lifestyle. Nevertheless, because of sparse biological data for these protist groups, our classification of protist SNAREs ought to be verified in the future.

Evolution of the SNARE Apparatus Is Linked to the Development of the Endomembrane System

Our analysis suggests that the 20 basic SNARE subgroups discriminated by our HMM profiles represent the repertoire of SNARE proteins of the eukaryotic ancestor. Almost certainly, in the eukaryotic ancestor these 20 SNARE types operated already in vesicular trafficking steps between the major intracellular compartments that are conserved in almost all contemporary eukaryotes. It has been proposed that the different intracellular compartments of a eukaryotic cell, along with the molecular machineries involved in vesicular trafficking, emerged by events of duplication and diversification of a simpler endomembrane system of a more primitive ancestor (Roger, 1999 Cavalier-Smith, 2002). Possibly, the development of the 20 basic SNARE types is closely intertwined with the development of different intracellular compartments. In fact, it had been discussed earlier that the machineries involved in vesicular trafficking appear not only to be conserved through phylogeny of species but also throughout the different compartments of the cell (Bock et al., 2001), although the species included in this study by far did not represent the entire eukaryotic diversity. In subsequent studies, the presence of different conserved syntaxin subfamilies (i.e., mostly Qa-SNAREs) in several diverse eukaryotes supported the notion that these SNAREs diverged early in eukaryotic evolution (Dacks and Doolittle, 2002, 2004). The early diversification of SNARE proteins is also corroborated by the fact that other, distantly related eukaryotes encompass relatively conserved SNARE sets (Besteiro et al., 2006 Schilde et al., 2006 Yoshizawa et al., 2006 Ayong et al., 2007 Kissmehl et al., 2007 and our analysis). Notably, our study substantiates the view that all SNARE proteins principally split into the four major phylogenetic classes: Qa, Qb, Qc, and R (Bock et al., 2001), suggesting that the prototypic unit was composed of four different SNARE proteins, able to assemble into a tight four-helix bundle between two fusing membranes. Thus, it is likely that during the early stages of eukaryotic evolution entire SNARE units rather than the single subunits were duplicated. These prototypic SNARE units diverged afterward. In fact, we detected some patterns of coevolution in the different SNARE units, in particular in the Q-SNAREs of group I, but promiscuous interactions between different SNARE subunits may have precluded further diversifications. The phylogenetic trees obtained from SNARE proteins of different eukaryotic species (Figure 3 and Supplementary Material), together with the relative simple domain architecture of the SNAREs (Figure 1), allow for some tentative speculations about the nature of a prototypic SNARE machinery: Because all ancestral R-SNARE types appear to contain an N-terminal domain with a profilin-like fold (Figure 1 Gonzalez et al., 2001 Tochio et al., 2001 Wen et al., 2006), they may have originated from a common ancestor that contained this N-terminal extension. Note that this domain has been lost in the secretory R.IV-SNAREs in fungi and animals. Similarly, all Qa-SNAREs exhibit a very similar domain architecture, carrying an N-terminal three-helix bundle structure (Fernandez et al., 1998 Lerman et al., 2000 Misura et al., 2000 Munson et al., 2000 Dulubova et al., 2001). Interestingly, several of the Qb- and the Qc-SNAREs possess an N-terminal three-helix bundle as well (Antonin et al., 2002a Misura et al., 2002 Fridmann-Sirkis et al., 2006). This hints at a common origin of all three main Q-SNARE groups from a prototypic Q-SNARE. Hence, a scenario can be envisioned in which originally a trimer of a prototypic Q-SNAREs on the target membrane interacted with a prototypic R-SNARE on the vesicular membrane. However, this partition between the two membranes is so far only established for the secretory SNAREs, whereas in other trafficking steps the distribution of the four SNARE subunits is still heavily debated. Therefore, it is challenging to bring our data into line with biological knowledge. For example, a different notion about the prototypic SNARE unit might be supported by the fact that in the species trees (e.g., Figure 3) the four basic SNARE groups partition into two elementary groups, one containing the R- and Qb-SNAREs and one containing the Qa- and Qc-SNAREs. These splitting can be observed in species trees of animals, protists, and plants. Interestingly, the two main branches each unite the two diagonally opposite helices of the four-helix bundle SNARE complex. Notably, these two main branches in general exhibit a comparable topology of the subgroup splits, possibly reflecting coevolution.

The two trees obtained from fungi species show a different splitting, but can be brought into line as can be seen from the tree containing all eleven species (data set in Supplementary Materials). In this tree the support of the inner splitting is somewhat decreased compared with a tree without the fungi species (data not shown). A more detailed phylogenetic analysis of the evolution of SNAREs within the different eukaryotic kingdoms seems to be of interest but is beyond the scope of this article.

Analogous themes of duplication and divergence for other important factors involved in intracellular membrane trafficking have been exposed and implicated in the evolution of the eukaryotic endomembrane system, for example, for the organelle-specific Rab GTPases (Pereira-Leal and Seabra, 2001 Jekely, 2003) and tethering factors involved in vesicular trafficking (Koumandou et al., 2007). Similarly, coat protein–based budding of transport vesicles is mediated by different but homologous protein machineries at different donor organelles: COPI, COPII, and clathrin (McMahon and Mills, 2004). Related protein machineries have been even implicated in the establishment of the nuclear envelope (Devos et al., 2004 Mans et al., 2004) and the eukaryotic cilium (Jekely and Arendt, 2006). Very likely these factors evolved from a prototypic unit that was able to generate areas of highly curved membranes. Together, the development of such prototypic protein machineries provided the raw material for the intricate evolution of the endomembrane system of the eukaryotic cell.


참고문헌

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List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature/Prokaryotic Nomenclature Up-to-date

Prokaryotic Nomenclature Up-to-Date (PNU) was a compilation of all names of Bacteria and Archaea which have been validly published according to the Bacteriological Code since
1. Jan. 1980, and nomenclatural changes which have been validly published since. It was updated with the publication of each new issue of the International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM). In February 2020 PNU the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) was transferred to DSMZ. The new LPSN established at DSMZ superseded PNU.

How to access LPSN

The new LPSN page offers hierarchical and alphabetic browsing of prokaryotic names and has an advanced search facility. Alternatively, you may go to LPSN Downloads and select one of the lists in CSV or Excel format. Additionally, content can be retrieved in machine readable JSON format by the LPSN web service (API).

How to cite LPSN or PNU

For citing LPSN please see the LPSN page. PNU is not updated any longer. If you used the previous PNU Excel or PDF download or the previous PNU API, please cite it as: Leibniz Institute DSMZ-German Collection of Microorganisms and Cell Cultures GmbH, Germany, Prokaryotic Nomenclature Up-to-date [month and year of the last update].

The science of taxonomy

A more detailed overview of the mechanisms of valid publication of a name according to the Bacteriological Code can be found at LPSN, see also taxonomy & systematics and deposit of a proposed type strain.
The Approved Lists (Skerman et al., 1980) contain more than 2200 names at the genus level and below and 124 names of higher taxa. Validation Lists and taxon descriptions in the IJSB/IJSEM have been published regularly since. The total number of validly published names of prokaryotes increased considerably since then, see LPSN.

Skerman, V.B.D., McGowan, V. & Sneath, P.H.A. (1989). Approved Lists of Bacterial Names. Amended edition. American Society for Microbiology, Washington.

Helpful links regarding taxonomy

Below you will find several useful links concerning prokaryotic taxonomy:

  • List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
  • DSMZ Single-Gene Phylogenies and Gene Similarities Server
  • Key to Peptidoglycan Types
  • GGDC (Genome-To-Genome Distance Calculator) Web Server

Prokaryotic Nomenclature Up-to-Date was established at the DSMZ by Norbert Weiss, Manfred Kracht and Dorothea Gleim. After transferring LPSN to DSMZ, LPSN replaced PNU and is now maintained by Privatdozent Dr. Markus Göker and a team of curators and computer scientists. For any issues regarding content or technical aspects contact us. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature and Prokaryotic Nomenclature up-to-date are published by the Leibniz Institute DSMZ-German Collection of Microorganisms and Cell Cultures GmbH. The DSMZ accepts no responsibility for any errors.


Classy Classification

Eukarya includes all plants, fungi, protists, and animals. False parasol is put into this category because it has a true nucleus and has membrane bound organelles. It is multi-cellular and reproduces. Orchids and monarch butterflies also belong to this domain.

Taken by Kenneth Dwain Harrelson

Super-group: Opisthokonta

Animals and fungi both fall under this super-group along with choanoflagellates which are the closest protists to the animals. The giraffe and the polar bear are animals that also fall into this grouping.

Kingdom: Fungi

All fungi are non-vascular which means they have no specialized tissues. Fungi also reproduce by means of spores either asexually or sexually. This kingdom also has alternation of generations which means it has different multi-cellular stages throughout its life. Another organism classified as a fungi is the black bread mold.


Photo by Juila Photo by Tom Volk


Phylum: Basidiomycota

This phylum includes fungi that have their spores borne externally on club-like shaped structures called basidia. Another mushroom that is in this family is the yellow chanterelle.

Class: Agaricomycetes

This class is very diverse with over 16,000 species. Typically these organisms have mushrooms (fruiting bodies) used for reproduction. A lot of edible mushrooms fall within this class but Chlorophyllum molybdites is not one of those. Chlorophyllum molybdites fall into this class because they do produce a mushroom. Another organism that falls within this class is the Pearl Oyster Mushroom.

Order: Agaricales

This order typically contains mushrooms that have gills. These gills are important for reproduction of spores that will be dispersed into the environment. Chlorophyllum molybdites has these gills on the underside placing it in the order agaricales. The Magic Mushroom and Schizophyllum commune are great examples of this order.

Family: Agaricaceae

The mushroom Chlorophyllum molybdites belongs to the Agaricaceae family because of its blade-shaped gills on the underside of the cap. These fungi also are all saprobic meaning they get their food from dead or dying organic material. The Lepiota americana and the wolf-fart puffball are other species within this family.

Genus: Chlorophyllum

Those organisms belonging to this genius have thick-walled spores and sturdy basidiocarps. They also have the ability to grow on lawns and are in a wide distribution area. Originally color was the deciding factor of classification however DNA analysis was done and now 16 species join this genus, including Macrolepiota procera: The Parasol Mushroom.

Species: Chlorophyllum molybdites

In Latin, chloro means green, phylum means gills and molybdites means lead colored. This makes sense because this mushroom typically has green spots in the mature stages. The mushroom Chlorophyllum molybdites is also called Green-spored Lepiota or false parasol.


This phylogenic tree is based on a cladistic approach or shared derived characteristics. Phylogenic trees can be determined by morphology (physical characteristics) and also by DNA sequencing. At the bottom the tree divides between prokaryotic and eukaryotic. Prokaryotic means "before nuclei" explaining that prokaryotic cells lack nuclei. Conversely, mushrooms have cells that contain nuclei so they fall into the domain Eukarya. Within Eukarya, it is believed that plants evolved from protists and that animals and fungi are more closely related. The Proceedings of the Nation Academy of Sciences of the United States of America examined different proteins such as actin, alpha-tubulin, beta-tubulin, and elongation factor 1 alpha. They concluded that animals and fungi have very similar proteins. Also the scientists stated that animals and fungi are a monophyletic group, meaning they share a common ancestor. They found no evidence to link animals and plants or fungi and plants as more closely related. This is interesting because for the longest time people assumed plants and fungi were more closely related. Before my biology classes, if I would have been asked if a daisy or a cheetah were more closely related to a mushroom I would have said a dasiy! Now I know better, I hope you do too. Anyway, there are 5 phylum of fungi mainly broken down by the way they reproduce. Basidiomycota is the monophyletic phylum that contains Chlorophyllum molybdites along with many others.


Basidiomycota is broken down into many different classes, orders, families, genus', and species. Scientists estimated that there are roughly 30,000 different types of fungi species in this phylum. More information on this research can be seen here. Within the Basidiomycota phylum it is broken down based off of rRNA sequencing. The tree to the right is showing a closer look at how the genus Chlorophyllum breaks down into species. This tree shows the relationships between the species based on ITS-sequences. These species were found from all around the world including, North America, Pacific Island, South America, Asia, Australia, Africa, and Europe. Else C. Vellinga has a nice journal that can be found online that goes in more depth.

From this tree we can determine that the closest relationship to Chlorophyllum molybdites is Chlorophyllum globosum. Chlorophyllum is also a monophyletic group with a common ancestor. The species within this genus are very widespread. Many of these species were not included in the genus because they were not green. After researching the DNA of these organisms they found more similarities and some species were moved into this group even though they lack the green coloring.


8.5B: Classification of Prokaryotes - Biology

What is a Prokaryote?

    There are two basic types of organisms based on cell type: Prokaryotic and Eukaryotic.

    Prokaryotic cells are divided into the domains Bacteria and Archaea.

    Most prokaryotes are tiny single cells, but some can form larger, multi-celled structures.

    Bacteria are a very diverse group that have several shapes, depending on the species.

    Extreme thermophiles live in hot places such as volcanic springs and hydrothermal vents.

Prokaryotic Cells: What Structures Are Present in All Cells?

    There all several essential structures that all cells must have to survive.

    The membrane has a lipid-protein structure.

    The chromosome of most prokaryotes is circular and packed within the nucleoid region.

Prokaryotic Cells: What Are Some Additional Features of These Cells?

    Almost all prokaryotes have a cell wall bacteria can be divided into two groups based on the structure of their cell wall and how it responds to Gram staining technique.



코멘트:

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