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"차등 성적표 사용"(DTU)에 대한 설명



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이 백서는 차등 성적표 사용을 다음과 같이 설명합니다.

차등 전사 사용(DTU)은 유전자의 상대 전사 풍부도(RTA) 프로파일, 각 유전자 전사 동형에서 발생하는 총 유전자 수준 발현의 비율이 조건에 따라 다른 대체 스플라이싱의 특별한 경우입니다(Soneson et al. ., 2016). [… ] DTU의 예는 전체 유전자 발현이 조건 A와 B 사이에서 동일하지만 전사체 이소형 1이 조건 A에서 우세하게 발현되는 전사체이고 전사체 이소형 2가 조건 A에서 우세하게 발현되는 전사체인 시나리오에 의해 설명될 수 있습니다 NS.

내 질문은 차등 전사 사용이 본질적으로 특정 코돈의 사용 수준과 동일합니까? 그렇지 않다면 차이점은 무엇입니까? 나는 "transcript isoforms"가 무엇인지 확신하지 못하기 때문에 여기에서 말하는 코돈에 대해 말하는 것인지 아니면 완전히 다른 것에 대해 말하는 것인지 잘 모르겠습니다.


아니요, 접합 및 대체 접합과 관련이 있는 완전히 다른 것입니다.

스플라이싱 및 대체 스플라이싱에 대한 자세한 내용은 유전학 텍스트를 참조하세요. 하지만 여기에서 이것이 무엇이며 DTU에 어떻게 포함되는지에 대한 매우 간단하고 불완전한 설명을 제공할 것입니다.

유전자는 인트론과 엑손으로 구성되어 있습니다. 엑손은 유전자의 유일한 부분입니다. 대개 성숙한 전사체 구성(인트론 보유가 가능하지만 우리는 그것에 관심이 없습니다). 스플라이싱은 진핵생물 유전자에서 인트론이 제거되고 성숙한 전사체는 엑손만을 사용하여 조립되는 메커니즘입니다. 접합하는 동안 모든 엑손이 반드시 유지되는 것은 아닙니다. 엑손 1, 2, 3이 있는 유전자를 상상해 보십시오. 이소폼)는 엑손 1, 2, 3으로 구성된 것입니다. 동형 1. 그러나 이라는 현상으로 인해 대체 접합, 다른 동형, 예를 들어 엑손 1과 3으로 구성된 하나의 동형이 생성될 수 있습니다. 동형 2. 평균적으로 우리는 풍부하다고 상상할 수 있습니다. 동형 1 에 비해 동형 2 오히려 일정합니다. 그러나 일부 치료 또는 환경 자극의 일부 변화는 다음을 유발할 수 있습니다. 차등 성적표 사용 이에 따라 두 동형의 상대적 풍부도가 변경됩니다.



코멘트:

  1. Konni

    완전 나쁜 맛

  2. Verney

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